【答案】D

【解析】该基因共有2000对脱氧核苷酸组成，其中鸟嘌呤占30%，因此该基因中含有鸟嘌呤数目为2000×2×30%=1200个，则基因复制2次，则需要游离的鸟嘌呤脱氧核苷酸数目=（22-1）×1200=3600个，A错误；基因Y复制时解旋酶作用于③处，即氢键，B错误；若②处T//A替换为G//C，由于密码子的简并性等原因，Y控制的性状不一定发生改变，C错误；Y的等位基因y是基因突变形成的，基因突变是指碱基对的增添、缺失或替换，因此y中碱基A也可能占20%，D正确。