【答案】(1)大气　生物　水　岩石　土壤　(2)整体性　黄河中下游　(3)生物状况　肥力下降　水土流失　盐渍化　荒漠化　土壤污染(任选三项)

【解析】（1）读图可知，图示地区范围较大，涉及陆地和海洋。①处于陆地上空，属于大气圈；②是指森林，属于生物圈；③处于海洋中，属于水圈；④处为沉积岩，属于岩石圈；⑤属于能够生长植物的土壤圈。

（2）土壤既是自然地理环境的一个要素，也是反映自然地理环境整体性的一面“镜子”。（3）人类活动对土壤的影响既有积极方面，也有消极方面。人类生产活动对土壤形成的作用，以改变地表生物状况最为突出。人类活动既可以培育出一些肥沃、高产的耕作土壤，也可能引起土壤退化，如出现肥力下降、水土流失、盐渍化、荒漠化、土壤污染等问题。