【答案】（1）与东北地区相比，河西走廊光照时间长；昼夜温差大。与新疆相比，铁路、高速公路横穿河西走廊，交通便利。

（2）河西走廊耕地较多且集中，土质肥沃；境内有多条河流和冰雪融水，水量稳定，灌溉条件好；光照充足、昼夜温差大，有利于农作物的光合作用和物质积累；秋季多晴天，气候干燥、空气流动快，土质疏松、透气性好，有利于种子的干燥脱水；铁路、高速公路横穿河西走廊，交通便利。

（3）河西走廊地处西部内陆，生态环境脆弱，大规模发展制种产业，可能会加剧环境恶化，导致水资源短缺；土壤盐碱化；土地荒漠化等生态环境问题。

【解析】（1）河西走廊与东北地区相比，主要优势是光照时间长；昼夜温差大。与新疆相比主要是交通便利。

（2）因为河西走廊地处西部内陆，降水少，生态环境脆弱，大规模发展制种产业，可能会加剧环境恶化，导致水资源短缺；不合理的灌溉可能导致土壤盐碱化；干旱地区易产生土地荒漠化等生态环境问题。